污染防治措施是確保企業(yè)按證排污的前提和保障，但許可證制度設(shè)計(jì)中并未將其納入許可事項(xiàng)，主要從鼓勵(lì)企業(yè)不斷提高污染治理水平的角度考慮。在不屬于環(huán)境影響評(píng)價(jià)制度有關(guān)規(guī)范性文件確定的重大變更的情形下，企業(yè)污染治理措施發(fā)生變化時(shí)，如果有利于減少污染物的排放或者不增加污染物排放，這是允許的，不需要向環(huán)保部門(mén)申請(qǐng)變更排污許可證，但需在按規(guī)定上報(bào)的執(zhí)行報(bào)告中予以詳細(xì)說(shuō)明；如果污染治理措施發(fā)生的變化導(dǎo)致增加污染物排放量，企業(yè)則需要申請(qǐng)變更排污許可證。

為較好的判斷污染治理措施發(fā)生變化后環(huán)境影響變化情況，環(huán)保部門(mén)將依據(jù)排污許可證推進(jìn)時(shí)間進(jìn)度安排，按行業(yè)逐步出臺(tái)各行業(yè)污染治理最佳可行技術(shù)指南，如果企業(yè)治理措施的變化均在可行技術(shù)范圍內(nèi)，且不新增污染物種類(lèi)，則認(rèn)為其污染物排放量在允許范圍內(nèi)，無(wú)需申請(qǐng)變更排污許可證；如不在此范圍內(nèi)，企業(yè)需要提供證明材料和監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)，并向環(huán)保部門(mén)申請(qǐng)變更排污許可證。