建立全國統(tǒng)一的排污許可證編碼是推動固定污染源精細(xì)化管理的重要手段，是實現(xiàn)固定污染源信息化管理的基礎(chǔ)，是建立全國污染源清單的重要技術(shù)支撐。因此，在排污許可制頂層設(shè)計方案中很早就提出要實現(xiàn)排污許可證編碼的統(tǒng)一。

目前環(huán)保部已經(jīng)基本完成排污許可證編碼規(guī)則的制定，按此規(guī)則排污許可證的編碼體系由固定污染源編碼、生產(chǎn)設(shè)施編碼、污染物處理設(shè)施編碼、排污口編碼4大部分共同組成。

固定污染源編碼與企業(yè)實現(xiàn)一一對應(yīng)，主要用于標(biāo)識環(huán)境責(zé)任主體，它由主碼和副碼組成，其中主碼包括18位統(tǒng)一社會信用代碼、3位順序碼和1位校驗碼組成；副碼為4位數(shù)的行業(yè)類別代碼標(biāo)識，主要用于區(qū)分同一個排污許可證代碼下污染源所屬行業(yè)，當(dāng)一個固定污染源包含兩個及以上行業(yè)類別時，將對應(yīng)多個副碼。

生產(chǎn)設(shè)施編碼是指在固定污染源編碼基礎(chǔ)上，增加生產(chǎn)設(shè)施標(biāo)識碼和流水順序碼，實現(xiàn)企業(yè)內(nèi)部設(shè)施編碼的惟一性。生產(chǎn)設(shè)施標(biāo)識碼用MF表示，流水順序碼由4位阿拉伯?dāng)?shù)字構(gòu)成。

治理設(shè)施編碼和排污口編碼由標(biāo)識碼、環(huán)境要素標(biāo)識符（排污口類別代碼）和流水順序碼3個部分共5位字母和數(shù)字混合組成，并與固定污染源代碼一起賦予該治理設(shè)施或排污口全國唯一的編碼。

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